En el caso de las instituciones universitarias provinciales, la validez nacional de los títulos y grados otorgados exige el reconocimiento por parte del Poder Ejecutivo Nacional, el que se otorga previo informe favorable de CONEAU.
En la mayoría de los casos, la CONEAU consulta a expertos con el fin de analizar la justificación, viabilidad y consistencia del proyecto institucional y académico y su adecuación a los principios y normas de la LES, el nivel académico del cuerpo de profesores con el que la institución cuenta, así como su trayectoria en la investigación científica y en docencia universitaria, la calidad y actualización de los planes de enseñanza e investigación propuestos, los medios económicos y la vinculación internacional, acuerdos y convenios.